在保卫萝卜新版本中更新了一个挑战模式，这个模式要比普通的模式更加困难，不过通关的奖励也更加丰富。在挑战模式中第二十关很有意思，难度也有一些高，很多玩家都卡在这个关卡过不去，关卡中有很多道具以及建筑，很多玩家都是在前面，没有合理安排好金币以及位置，从而导致失败。
在第二十关，我们每人初始只有一千二的金币，并且每个空位距离都比较远，炮台只能选择火箭、魔法球以及便便，攻击方式比较少。在进入游戏之后，首先需要在起点位置建造一个火箭，在前期主要是铺垫，攻击到不是很有必要，建造完成之后就要开始升级了，尽可能多升几级。当第一波小怪出来的时候，使用魔法球消除起点位置的道具，清除掉左边第一个箱子之后可以获得到四个便便武器，只留下一个就可以了，因为便便的攻击力比较小，并且攻击速度很慢。右上角的宝箱爆出来可以获得四个蘑菇，同样只留下一个就可以了，下面的两个宝箱清理掉之后，操作也是一样的。当我们将道具全部清理完之后，准备工作以及完成了，在地图的中心位置建造两排魔法球，并且在起点位置尽量多去建造火箭，金币足够的话，首先升级火箭，多余的升级魔法球。当boss出现的时候，按照它的移动轨迹来建造炮台就可以了。第二十关一共有三十波小怪，总体难度有点高，但是玩家细心一点的话，第二十关很容易就可以通过。
除了二十关之外，第二十九关也是比较复杂的关卡，这个关卡虽然只有六波的怪物，但是通过起来却不简单。在这个关卡中，我们并没有减速道具，所以需要尽可能的快速消灭怪物，这也是想要取得胜利最好的办法，在刚开始玩家只有五百的金币，一定需要合理利用，唯一值得庆幸的是，关卡中地图比较长，有着很多的时间可以去布置炮台，为我们减轻一些压力。开局之后现在起点与终点建立两个火箭，起点位置主要消灭怪物，终点主要将云朵全部清除掉，云朵可以掉落多重箭，攻击速度以及攻击力都比较不错。有钱之后优先升级火箭，道具不用急着清除，主要攻击小怪，以免萝卜受损，在第四波之后怪物就变得非常多，同时金币奖励也很丰厚，金币充足之后，尽量多去建造火箭以及提升等级。在第五波之前需要建立至少十个火箭，并且多重箭需要升到满级，否则后面会很难通过，在关卡中只有雪花可以造成减速，一定需要升到最高级。第五波打完之后金币也比较多，如果觉得自己手速比较慢的话，可以点击暂停，将场面中所有的炮台全部升到最满级，在终点位置多建立一些瓶子炮，它的攻击有穿透性，在最后一波作用比较大。第六波虽然怪多，但是血比较薄，炮台全部满级之后很容易就可以通过了。